#include "utility_AMOS.hh"
#include <string>
#include <vector>
#include <iostream>
Include dependency graph for Message_AMOS.hh:
This graph shows which files directly or indirectly include this file:
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Namespaces | |
| namespace | AMOS |
Classes | |
| class | AMOS::Message_t |
| A generic AMOS message object for reading and writing data. More... | |
| class | AMOS::IMessagable_t |
| Interface for classes that can interpret messages. More... | |
Defines | |
| #define | __Message_AMOS_HH 1 |
| #define | AMOS_ENCODE(a, b, c) ((((c << CHAR_BIT) | b) << CHAR_BIT) | a) |
Variables | |
| const char | AMOS::E_ADD = 'A' |
| const char | AMOS::E_DELETE = 'D' |
| const char | AMOS::E_REPLACE = 'R' |
| const NCode_t | AMOS::F_NULL = AMOS_ENCODE ('n','u','l') |
| const NCode_t | AMOS::F_AHANG = AMOS_ENCODE ('a','h','g') |
| const NCode_t | AMOS::F_ACTION = AMOS_ENCODE ('a','c','t') |
| const NCode_t | AMOS::F_ADJACENCY = AMOS_ENCODE ('a','d','j') |
| const NCode_t | AMOS::F_BASEPOSITION = AMOS_ENCODE ('b','c','p') |
| const NCode_t | AMOS::F_BHANG = AMOS_ENCODE ('b','h','g') |
| const NCode_t | AMOS::F_BID = AMOS_ENCODE ('b','i','d') |
| const NCode_t | AMOS::F_CLEAR = AMOS_ENCODE ('c','l','r') |
| const NCode_t | AMOS::F_COMMENT = AMOS_ENCODE ('c','o','m') |
| const NCode_t | AMOS::F_COUNT = AMOS_ENCODE ('c','n','t') |
| const NCode_t | AMOS::F_EID = AMOS_ENCODE ('e','i','d') |
| const NCode_t | AMOS::F_EDGE = AMOS_ENCODE ('e','d','g') |
| const NCode_t | AMOS::F_FLAG = AMOS_ENCODE ('f','l','g') |
| const NCode_t | AMOS::F_FRAGMENT = AMOS_ENCODE ('f','r','g') |
| const NCode_t | AMOS::F_GAPS = AMOS_ENCODE ('g','a','p') |
| const NCode_t | AMOS::F_IID = AMOS_ENCODE ('i','i','d') |
| const NCode_t | AMOS::F_LIBRARY = AMOS_ENCODE ('l','i','b') |
| const NCode_t | AMOS::F_LINK = AMOS_ENCODE ('l','n','k') |
| const NCode_t | AMOS::F_MAP = AMOS_ENCODE ('m','a','p') |
| const NCode_t | AMOS::F_MEAN = AMOS_ENCODE ('m','e','a') |
| const NCode_t | AMOS::F_MEMBER = AMOS_ENCODE ('m','b','r') |
| const NCode_t | AMOS::F_NODES = AMOS_ENCODE ('n','d','s') |
| const NCode_t | AMOS::F_OBJECT = AMOS_ENCODE ('o','b','j') |
| const NCode_t | AMOS::F_OFFSET = AMOS_ENCODE ('o','f','f') |
| const NCode_t | AMOS::F_POSITION = AMOS_ENCODE ('p','o','s') |
| const NCode_t | AMOS::F_QUALITY = AMOS_ENCODE ('q','l','t') |
| const NCode_t | AMOS::F_QUALITYCLEAR = AMOS_ENCODE ('q','c','r') |
| const NCode_t | AMOS::F_READS = AMOS_ENCODE ('r','d','s') |
| const NCode_t | AMOS::F_SCORE = AMOS_ENCODE ('s','c','r') |
| const NCode_t | AMOS::F_SEQUENCE = AMOS_ENCODE ('s','e','q') |
| const NCode_t | AMOS::F_SD = AMOS_ENCODE ('s','t','d') |
| const NCode_t | AMOS::F_SIZE = AMOS_ENCODE ('s','z','e') |
| const NCode_t | AMOS::F_SOURCE = AMOS_ENCODE ('s','r','c') |
| const NCode_t | AMOS::F_STATUS = AMOS_ENCODE ('s','t','s') |
| const NCode_t | AMOS::F_TYPE = AMOS_ENCODE ('t','y','p') |
| const NCode_t | AMOS::F_VECTORCLEAR = AMOS_ENCODE ('v','c','r') |
| const NCode_t | AMOS::M_NULL = AMOS_ENCODE ('N','U','L') |
| const NCode_t | AMOS::M_UNIVERSAL = AMOS_ENCODE ('U','N','V') |
| const NCode_t | AMOS::M_CONTIG = AMOS_ENCODE ('C','T','G') |
| const NCode_t | AMOS::M_CONTIGEDGE = AMOS_ENCODE ('C','T','E') |
| const NCode_t | AMOS::M_CONTIGLINK = AMOS_ENCODE ('C','T','L') |
| const NCode_t | AMOS::M_DISTRIBUTION = AMOS_ENCODE ('D','S','T') |
| const NCode_t | AMOS::M_EDGE = AMOS_ENCODE ('E','D','G') |
| const NCode_t | AMOS::M_FEATURE = AMOS_ENCODE ('F','E','A') |
| const NCode_t | AMOS::M_FRAGMENT = AMOS_ENCODE ('F','R','G') |
| const NCode_t | AMOS::M_GROUP = AMOS_ENCODE ('G','R','P') |
| const NCode_t | AMOS::M_KMER = AMOS_ENCODE ('K','M','R') |
| const NCode_t | AMOS::M_LAYOUT = AMOS_ENCODE ('L','A','Y') |
| const NCode_t | AMOS::M_LIBRARY = AMOS_ENCODE ('L','I','B') |
| const NCode_t | AMOS::M_LINK = AMOS_ENCODE ('L','N','K') |
| const NCode_t | AMOS::M_IDMAP = AMOS_ENCODE ('M','A','P') |
| const NCode_t | AMOS::M_INDEX = AMOS_ENCODE ('I','D','X') |
| const NCode_t | AMOS::M_OVERLAP = AMOS_ENCODE ('O','V','L') |
| const NCode_t | AMOS::M_READ = AMOS_ENCODE ('R','E','D') |
| const NCode_t | AMOS::M_SCAFFOLD = AMOS_ENCODE ('S','C','F') |
| const NCode_t | AMOS::M_SCAFFOLDEDGE = AMOS_ENCODE ('S','C','E') |
| const NCode_t | AMOS::M_SCAFFOLDLINK = AMOS_ENCODE ('S','C','L') |
| const NCode_t | AMOS::M_SEQUENCE = AMOS_ENCODE ('S','E','Q') |
| const NCode_t | AMOS::M_TILE = AMOS_ENCODE ('T','L','E') |
Definition in file Message_AMOS.hh.
| #define __Message_AMOS_HH 1 |
Definition at line 12 of file Message_AMOS.hh.
| #define AMOS_ENCODE | ( | a, | |||
| b, | |||||
| c | ) | ((((c << CHAR_BIT) | b) << CHAR_BIT) | a) |
Definition at line 21 of file Message_AMOS.hh.
1.4.7