Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

- g -

• gap2ungap() : AMOS::Contig_t
• gaps : AMOS::Tile_t
• getAdjacency() : AMOS::Overlap_t, AMOS::Link_t
• getAhang() : AMOS::Overlap_t
• getAvgRho() : AMOS::Contig_t
• getBase() : AMOS::Sequence_t, AMOS::Kmer_t
• getBaseInfo() : AMOS::Column_t
• getBasePositions() : AMOS::Read_t
• getBegin() : AMOS::Range_t
• getBhang() : AMOS::Overlap_t
• getBuckets() : AMOS::IDMap_t
• getClearRange() : AMOS::Read_t
• getColumn() : AMOS::ContigIterator_t
• getComment() : AMOS::Universal_t
• getContig() : AMOS::ContigIterator_t
• getContigEdges() : AMOS::Scaffold_t
• getContigLinks() : AMOS::ContigEdge_t
• getContigs() : AMOS::ContigLink_t
• getContigTiling() : AMOS::Scaffold_t
• getCount() : AMOS::Kmer_t
• getCovStat() : AMOS::Contig_t
• getDistribution() : AMOS::Library_t
• getEID() : AMOS::IBankable_t
• getEnd() : AMOS::Range_t
• getField() : AMOS::Message_t
• getFragment() : AMOS::Read_t
• getFragmentPosition() : AMOS::Read_t
• getGappedLength() : AMOS::Tile_t
• getGCContent() : AMOS::Sequence_t, AMOS::Contig_t
• getHi() : AMOS::Range_t
• getIDMap() : AMOS::Bank_t
• getIDMapSize() : AMOS::Bank_t
• getIID() : AMOS::IBankable_t
• getIndexSize() : AMOS::Bank_t
• getLastPartition() : AMOS::Bank_t
• getLength() : AMOS::Sequence_t, AMOS::Kmer_t, AMOS::Range_t
• getLibrary() : AMOS::Fragment_t
• getLinks() : AMOS::IEdge_t
• getLo() : AMOS::Range_t
• getMatePair() : AMOS::Fragment_t
• getMaxBID() : AMOS::Bank_t
• getMaxIID() : AMOS::Bank_t
• getMembers() : AMOS::Group_t
• getMemberType() : AMOS::Group_t
• getMessageCode() : AMOS::Message_t
• getNCode() : AMOS::Universal_t, AMOS::Sequence_t, AMOS::ScaffoldLink_t, AMOS::ScaffoldEdge_t, AMOS::Scaffold_t, AMOS::Read_t, AMOS::Overlap_t, AMOS::IMessagable_t, AMOS::Link_t, AMOS::Library_t, AMOS::Layout_t, AMOS::Kmer_t, AMOS::Index_t, AMOS::IDMap_t, AMOS::Group_t, AMOS::Fragment_t, AMOS::Feature_t, AMOS::Edge_t, AMOS::IEdge_t, AMOS::Tile_t, AMOS::Distribution_t, AMOS::ContigLink_t, AMOS::ContigEdge_t, AMOS::Contig_t, AMOS::IBankable_t
• getNodes() : AMOS::Link_t
• getNodeType() : AMOS::ScaffoldLink_t, AMOS::Link_t, AMOS::ContigLink_t
• getPartition() : AMOS::Bank_t
• getQualityClearRange() : AMOS::Read_t
• getQualString() : AMOS::Sequence_t
• getRange() : AMOS::Feature_t
• getReads() : AMOS::Overlap_t, AMOS::Kmer_t
• getReadTiling() : AMOS::Contig_t
• getRightOffset() : AMOS::Tile_t
• getScaffoldLinks() : AMOS::ScaffoldEdge_t
• getScaffolds() : AMOS::ScaffoldLink_t
• getScore() : AMOS::Overlap_t
• getSD() : AMOS::Link_t
• getSeqString() : AMOS::Sequence_t, AMOS::Kmer_t
• getSize() : AMOS::BankStreamSet_t, AMOS::BankSet_t, AMOS::UniversalSet_t, AMOS::Link_t, AMOS::Index_t, AMOS::IDMap_t, AMOS::Fragment_t, AMOS::Bank_t
• getSource() : AMOS::Link_t, AMOS::Fragment_t, AMOS::Feature_t
• getSpan() : AMOS::Scaffold_t, AMOS::Layout_t, AMOS::Contig_t
• getStatus() : AMOS::Universal_t, AMOS::Bank_t
• getSubMessages() : AMOS::Message_t
• getTiling() : AMOS::Layout_t
• getTilingReads() : AMOS::ContigIterator_t
• getType() : AMOS::Read_t, AMOS::Link_t, AMOS::Index_t, AMOS::IDMap_t, AMOS::Fragment_t, AMOS::Feature_t, AMOS::Bank_t
• getUngappedLength() : AMOS::Contig_t
• getUngappedQualString() : AMOS::Contig_t
• getUngappedSeqString() : AMOS::Contig_t
• getVectorClearRange() : AMOS::Read_t
• gindex() : AMOS::ContigIterator_t
• Group_t() : AMOS::Group_t
• GUANINE_BITS : AMOS::Sequence_t, AMOS::Kmer_t

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